Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT33BQ14525 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT33BQ14525 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.9 ms