Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL3Q13618 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
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