Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR1Q13613 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MTMR1Q13613 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR1Q13613 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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