Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRQ13535 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRQ13535 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRQ13535 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRQ13535 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRQ13535 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRQ13535 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRQ13535 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRQ13535 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRQ13535 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRQ13535 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRQ13535 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRQ13535 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRQ13535 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRQ13535 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRQ13535 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRQ13535 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRQ13535 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRQ13535 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRQ13535 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRQ13535 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRQ13535 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRQ13535 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRQ13535 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRQ13535 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRQ13535 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRQ13535 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRQ13535 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRQ13535 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRQ13535 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRQ13535 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRQ13535 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRQ13535 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRQ13535 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRQ13535 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRQ13535 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRQ13535 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRQ13535 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRQ13535 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRQ13535 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRQ13535 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRQ13535 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRQ13535 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRQ13535 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRQ13535 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRQ13535 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRQ13535 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRQ13535 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRQ13535 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRQ13535 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRQ13535 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRQ13535 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRQ13535 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRQ13535 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRQ13535 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRQ13535 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATRQ13535 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRQ13535 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRQ13535 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRQ13535 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRQ13535 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRQ13535 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRQ13535 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRQ13535 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRQ13535 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRQ13535 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRQ13535 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRQ13535 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRQ13535 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRQ13535 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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