Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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SCGB2A2Q13296 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCGB2A2Q13296 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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SCGB2A2Q13296 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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SCGB2A2Q13296 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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SCGB2A2Q13296 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SCGB2A2Q13296 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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