Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL28Q13084 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL28Q13084 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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