Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF3Q12996 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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