Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN13Q12923 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN13Q12923 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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