Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPTFQ12830 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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