Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NIPAL4Q0D2K0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL4Q0D2K0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms