Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC38A11Q08AI6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms