Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUDPQ08623 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUDPQ08623 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms