Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
DDR1Q08345 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDR1Q08345 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms