Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNB2Q08289 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB2Q08289 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms