Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF4Q08170 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms