Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC3A1Q07837 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms