Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK18Q07002 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK18Q07002 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms