Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FMODQ06828 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FMODQ06828 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FMODQ06828 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FMODQ06828 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FMODQ06828 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FMODQ06828 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FMODQ06828 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FMODQ06828 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FMODQ06828 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FMODQ06828 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FMODQ06828 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FMODQ06828 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FMODQ06828 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FMODQ06828 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FMODQ06828 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FMODQ06828 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FMODQ06828 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FMODQ06828 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FMODQ06828 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FMODQ06828 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FMODQ06828 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FMODQ06828 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FMODQ06828 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FMODQ06828 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FMODQ06828 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FMODQ06828 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FMODQ06828 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FMODQ06828 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FMODQ06828 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FMODQ06828 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FMODQ06828 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FMODQ06828 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FMODQ06828 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FMODQ06828 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FMODQ06828 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FMODQ06828 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FMODQ06828 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FMODQ06828 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FMODQ06828 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FMODQ06828 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FMODQ06828 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FMODQ06828 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FMODQ06828 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FMODQ06828 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FMODQ06828 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FMODQ06828 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FMODQ06828 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FMODQ06828 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FMODQ06828 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FMODQ06828 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FMODQ06828 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FMODQ06828 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FMODQ06828 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FMODQ06828 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FMODQ06828 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FMODQ06828 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FMODQ06828 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FMODQ06828 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FMODQ06828 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FMODQ06828 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FMODQ06828 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FMODQ06828 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FMODQ06828 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FMODQ06828 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FMODQ06828 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FMODQ06828 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FMODQ06828 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FMODQ06828 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FMODQ06828 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FMODQ06828 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FMODQ06828 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FMODQ06828 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FMODQ06828 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FMODQ06828 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FMODQ06828 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FMODQ06828 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FMODQ06828 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FMODQ06828 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FMODQ06828 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FMODQ06828 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms