Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABPAQ06546 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GABPAQ06546 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms