Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN12Q05209 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN12Q05209 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms