Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAP1Q03518 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAP1Q03518 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms