Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPCQ03188 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms