Protein–RNA interactions for Protein: Q02630

NUP116, Nucleoporin NUP116/NSP116, yeastyeast

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP116Q02630 TSR3YOR006C 942 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 ATG7YHR171W 1893 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 ERG1YGR175C 1491 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 SCO2YBR024W 906 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 ARO7YPR060C 771 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 UTP9YHR196W 1728 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 ERG7YHR072W 2196 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 LYS21YDL131W 1323 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 NPL6YMR091C 1308 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP116Q02630 DON1YDR273W 1098 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 NCS6YGL211W 1080 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 SYF2YGR129W 648 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 LDS1YAL018C 978 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YMR295CYMR295C 594 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 CSL4YNL232W 879 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 MRPL10YNL284C 969 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 RRS1YOR294W 612 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 RPN7YPR108W 1290 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 SSK22YCR073C 3996 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 GPB2YAL056W 2643 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 WHI2YOR043W 1461 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 TAH18YPR048W 1872 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YMR155WYMR155W 1644 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 MAK31YCR020C-A 267 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YET3YDL072C 612 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 RPN11YFR004W 921 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 ORM1YGR038W 669 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 EGD2YHR193C 525 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 GON7YJL184W 372 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YNR040WYNR040W 771 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 TRP3YKL211C 1455 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 VTH1YIL173W 4650 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 VTH2YJL222W 4650 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 MPM1YJL066C 759 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 KKQ8YKL168C 2175 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YKL223WYKL223W 333 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 COX17YLL009C 210 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YLR122CYLR122C 378 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 TAL1YLR354C 1008 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 TSA1YML028W 591 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 GUA1YMR217W 1578 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 LSG1YGL099W 1923 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 HST3YOR025W 1344 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 FRS2YFL022C 1512 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 NHA1YLR138W 2958 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 HVG1YER039C 750 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 TOM20YGR082W 552 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 PFA3YNL326C 1011 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 MRPS16YPL013C 366 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 PZF1YPR186C 1290 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 TBF1YPL128C 1689 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 SFB3YHR098C 2790 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 XBP1YIL101C 1944 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 BNA5YLR231C 1362 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 HSP78YDR258C 2436 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YDR015CYDR015C 240 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YEL068CYEL068C 333 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 CPA1YOR303W 1236 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 RNR3YIL066C 2610 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 FLC3YGL139W 2409 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 TIF2YJL138C 1188 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 APN1YKL114C 1104 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 TIF1YKR059W 1188 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YHM2YMR241W 945 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 CAF40YNL288W 1122 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 OST3YOR085W 1053 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 EPS1YIL005W 2106 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 YJU3YKL094W 942 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP116Q02630 ATP1YBL099W 1638 nt5.4□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 ICL1YER065C 1674 nt5.4□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 ALT1YLR089C 1779 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 RIM101YHL027W 1878 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 RAD3YER171W 2337 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YDL218WYDL218W 954 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 CDC34YDR054C 888 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 MOG1YJR074W 657 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 RHO4YKR055W 876 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YNL285WYNL285W 372 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 GSY2YLR258W 2118 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 DSF1YEL070W 1509 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YNR073CYNR073C 1509 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 VPS70YJR126C 2436 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 VBA1YMR088C 1689 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 MDM31YHR194W 1740 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YEH1YLL012W 1722 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 IDP1YDL066W 1287 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YER186CYER186C 921 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 SEC17YBL050W 879 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 POR1YNL055C 852 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YPR114WYPR114W 948 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 SUE1YPR151C 621 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 MTF2YDL044C 1323 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 MCM3YEL032W 2916 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 NOP2YNL061W 1857 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 HSP104YLL026W 2727 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 PKC1YBL105C 3456 nt5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.6 ms