Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A2Q01362 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms