Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAT1AQ00266 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAT1AQ00266 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms