Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNAQ00169 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNAQ00169 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms