Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3AP98173 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms