Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTRA4P83105 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HTRA4P83105 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms