Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CRB1P82279 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CRB1P82279 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRB1P82279 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRB1P82279 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRB1P82279 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRB1P82279 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRB1P82279 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CRB1P82279 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CRB1P82279 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CRB1P82279 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CRB1P82279 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CRB1P82279 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRB1P82279 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRB1P82279 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRB1P82279 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRB1P82279 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CRB1P82279 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CRB1P82279 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CRB1P82279 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CRB1P82279 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CRB1P82279 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CRB1P82279 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CRB1P82279 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CRB1P82279 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CRB1P82279 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CRB1P82279 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CRB1P82279 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CRB1P82279 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CRB1P82279 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CRB1P82279 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CRB1P82279 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CRB1P82279 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CRB1P82279 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CRB1P82279 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CRB1P82279 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CRB1P82279 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CRB1P82279 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CRB1P82279 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CRB1P82279 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CRB1P82279 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CRB1P82279 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CRB1P82279 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CRB1P82279 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CRB1P82279 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CRB1P82279 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRB1P82279 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRB1P82279 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRB1P82279 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CRB1P82279 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CRB1P82279 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CRB1P82279 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CRB1P82279 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CRB1P82279 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CRB1P82279 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CRB1P82279 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRB1P82279 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRB1P82279 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRB1P82279 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRB1P82279 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRB1P82279 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CRB1P82279 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CRB1P82279 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRB1P82279 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRB1P82279 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRB1P82279 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRB1P82279 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRB1P82279 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CRB1P82279 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CRB1P82279 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CRB1P82279 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CRB1P82279 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRB1P82279 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRB1P82279 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRB1P82279 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CRB1P82279 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CRB1P82279 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CRB1P82279 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
CRB1P82279 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CRB1P82279 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CRB1P82279 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CRB1P82279 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CRB1P82279 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRB1P82279 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRB1P82279 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRB1P82279 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRB1P82279 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms