Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMF1P82094 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMF1P82094 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMF1P82094 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMF1P82094 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMF1P82094 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMF1P82094 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TMF1P82094 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMF1P82094 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMF1P82094 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMF1P82094 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TMF1P82094 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMF1P82094 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
TMF1P82094 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMF1P82094 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMF1P82094 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMF1P82094 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMF1P82094 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMF1P82094 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMF1P82094 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMF1P82094 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TMF1P82094 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMF1P82094 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMF1P82094 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMF1P82094 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMF1P82094 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMF1P82094 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMF1P82094 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMF1P82094 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMF1P82094 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMF1P82094 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMF1P82094 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMF1P82094 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMF1P82094 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMF1P82094 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMF1P82094 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMF1P82094 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMF1P82094 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMF1P82094 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TMF1P82094 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMF1P82094 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TMF1P82094 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TMF1P82094 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TMF1P82094 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TMF1P82094 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TMF1P82094 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
TMF1P82094 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TMF1P82094 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TMF1P82094 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TMF1P82094 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMF1P82094 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TMF1P82094 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMF1P82094 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMF1P82094 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMF1P82094 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMF1P82094 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMF1P82094 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMF1P82094 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMF1P82094 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMF1P82094 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TMF1P82094 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TMF1P82094 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMF1P82094 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TMF1P82094 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMF1P82094 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMF1P82094 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMF1P82094 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMF1P82094 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMF1P82094 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMF1P82094 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMF1P82094 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMF1P82094 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMF1P82094 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TMF1P82094 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TMF1P82094 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMF1P82094 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMF1P82094 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMF1P82094 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TMF1P82094 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMF1P82094 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMF1P82094 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMF1P82094 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TMF1P82094 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TMF1P82094 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TMF1P82094 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TMF1P82094 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TMF1P82094 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TMF1P82094 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMF1P82094 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMF1P82094 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMF1P82094 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TMF1P82094 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TMF1P82094 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TMF1P82094 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TMF1P82094 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TMF1P82094 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TMF1P82094 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TMF1P82094 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TMF1P82094 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMF1P82094 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms