Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEP78395 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEP78395 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms