Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3BP2P78314 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2P78314 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2P78314 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms