Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4BP68371 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms