Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2D2P62837 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D2P62837 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms