Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms