Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS29P62273 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS29P62273 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS29P62273 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS29P62273 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS29P62273 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS29P62273 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS29P62273 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS29P62273 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS29P62273 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS29P62273 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS29P62273 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS29P62273 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS29P62273 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPS29P62273 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPS29P62273 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS29P62273 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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