Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCS1P62166 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCS1P62166 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCS1P62166 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCS1P62166 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCS1P62166 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCS1P62166 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCS1P62166 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCS1P62166 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCS1P62166 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCS1P62166 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCS1P62166 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCS1P62166 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCS1P62166 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCS1P62166 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCS1P62166 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCS1P62166 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NCS1P62166 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCS1P62166 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCS1P62166 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCS1P62166 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCS1P62166 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCS1P62166 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCS1P62166 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCS1P62166 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCS1P62166 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCS1P62166 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCS1P62166 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCS1P62166 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCS1P62166 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCS1P62166 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCS1P62166 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCS1P62166 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCS1P62166 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCS1P62166 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCS1P62166 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCS1P62166 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCS1P62166 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCS1P62166 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCS1P62166 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCS1P62166 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCS1P62166 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCS1P62166 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NCS1P62166 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCS1P62166 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms