Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP46P62068 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP46P62068 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP46P62068 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP46P62068 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP46P62068 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP46P62068 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP46P62068 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP46P62068 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP46P62068 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP46P62068 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP46P62068 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP46P62068 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP46P62068 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP46P62068 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP46P62068 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP46P62068 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP46P62068 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP46P62068 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP46P62068 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP46P62068 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP46P62068 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP46P62068 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP46P62068 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP46P62068 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP46P62068 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP46P62068 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP46P62068 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP46P62068 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP46P62068 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP46P62068 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP46P62068 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP46P62068 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP46P62068 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP46P62068 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP46P62068 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP46P62068 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP46P62068 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP46P62068 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP46P62068 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP46P62068 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP46P62068 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP46P62068 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP46P62068 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP46P62068 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP46P62068 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP46P62068 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP46P62068 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP46P62068 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP46P62068 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP46P62068 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP46P62068 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP46P62068 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP46P62068 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP46P62068 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP46P62068 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP46P62068 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP46P62068 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP46P62068 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP46P62068 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP46P62068 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP46P62068 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP46P62068 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP46P62068 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP46P62068 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP46P62068 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP46P62068 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP46P62068 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP46P62068 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP46P62068 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP46P62068 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP46P62068 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP46P62068 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP46P62068 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP46P62068 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP46P62068 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP46P62068 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms