Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCE1P61221 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms