Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR1AP61163 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR1AP61163 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms