Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVFC1P60507 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVFC1P60507 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms