Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VSX2P58304 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSX2P58304 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSX2P58304 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSX2P58304 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSX2P58304 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSX2P58304 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSX2P58304 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSX2P58304 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSX2P58304 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSX2P58304 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSX2P58304 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSX2P58304 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VSX2P58304 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VSX2P58304 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSX2P58304 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSX2P58304 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VSX2P58304 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSX2P58304 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSX2P58304 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSX2P58304 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSX2P58304 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSX2P58304 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VSX2P58304 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSX2P58304 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSX2P58304 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSX2P58304 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSX2P58304 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSX2P58304 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSX2P58304 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSX2P58304 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSX2P58304 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSX2P58304 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSX2P58304 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSX2P58304 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSX2P58304 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSX2P58304 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSX2P58304 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSX2P58304 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSX2P58304 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSX2P58304 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSX2P58304 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSX2P58304 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSX2P58304 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSX2P58304 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSX2P58304 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSX2P58304 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSX2P58304 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSX2P58304 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSX2P58304 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSX2P58304 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSX2P58304 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSX2P58304 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSX2P58304 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSX2P58304 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSX2P58304 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSX2P58304 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSX2P58304 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX2P58304 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX2P58304 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX2P58304 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX2P58304 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX2P58304 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX2P58304 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX2P58304 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX2P58304 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX2P58304 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX2P58304 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX2P58304 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX2P58304 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX2P58304 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSX2P58304 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSX2P58304 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms