Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB25P57735 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB25P57735 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB25P57735 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB25P57735 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB25P57735 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB25P57735 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB25P57735 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB25P57735 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB25P57735 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB25P57735 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB25P57735 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB25P57735 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB25P57735 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB25P57735 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB25P57735 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB25P57735 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB25P57735 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB25P57735 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB25P57735 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB25P57735 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB25P57735 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB25P57735 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB25P57735 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB25P57735 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms