Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP1P56182 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP1P56182 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP1P56182 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP1P56182 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP1P56182 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP1P56182 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP1P56182 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP1P56182 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP1P56182 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP1P56182 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP1P56182 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP1P56182 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP1P56182 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP1P56182 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP1P56182 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP1P56182 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP1P56182 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP1P56182 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP1P56182 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP1P56182 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP1P56182 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP1P56182 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP1P56182 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP1P56182 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP1P56182 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP1P56182 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP1P56182 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP1P56182 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP1P56182 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP1P56182 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP1P56182 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP1P56182 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP1P56182 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP1P56182 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP1P56182 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP1P56182 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP1P56182 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP1P56182 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP1P56182 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP1P56182 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP1P56182 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP1P56182 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP1P56182 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP1P56182 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP1P56182 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP1P56182 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP1P56182 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP1P56182 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP1P56182 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP1P56182 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP1P56182 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP1P56182 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP1P56182 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP1P56182 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RRP1P56182 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RRP1P56182 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP1P56182 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP1P56182 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP1P56182 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP1P56182 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP1P56182 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP1P56182 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP1P56182 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP1P56182 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP1P56182 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP1P56182 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP1P56182 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP1P56182 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP1P56182 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP1P56182 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP1P56182 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms