Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GFERP55789 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFERP55789 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFERP55789 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFERP55789 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFERP55789 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFERP55789 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFERP55789 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFERP55789 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFERP55789 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFERP55789 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GFERP55789 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFERP55789 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFERP55789 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFERP55789 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFERP55789 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFERP55789 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFERP55789 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFERP55789 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFERP55789 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFERP55789 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFERP55789 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFERP55789 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFERP55789 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFERP55789 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFERP55789 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFERP55789 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFERP55789 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFERP55789 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GFERP55789 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFERP55789 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFERP55789 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFERP55789 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFERP55789 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFERP55789 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFERP55789 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GFERP55789 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFERP55789 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GFERP55789 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFERP55789 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFERP55789 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFERP55789 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFERP55789 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFERP55789 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFERP55789 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GFERP55789 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFERP55789 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFERP55789 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFERP55789 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFERP55789 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GFERP55789 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFERP55789 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFERP55789 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFERP55789 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFERP55789 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GFERP55789 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFERP55789 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFERP55789 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFERP55789 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFERP55789 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFERP55789 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFERP55789 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFERP55789 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GFERP55789 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GFERP55789 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFERP55789 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFERP55789 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFERP55789 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms