Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52P55327 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52P55327 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52P55327 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52P55327 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52P55327 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52P55327 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52P55327 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52P55327 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52P55327 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPD52P55327 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPD52P55327 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPD52P55327 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPD52P55327 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPD52P55327 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52P55327 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52P55327 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52P55327 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52P55327 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52P55327 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52P55327 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52P55327 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52P55327 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52P55327 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52P55327 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52P55327 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52P55327 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52P55327 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52P55327 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52P55327 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52P55327 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52P55327 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52P55327 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52P55327 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPD52P55327 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52P55327 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52P55327 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52P55327 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52P55327 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52P55327 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52P55327 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52P55327 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52P55327 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52P55327 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52P55327 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52P55327 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52P55327 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52P55327 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52P55327 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52P55327 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52P55327 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms