Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCKAP1LP55160 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCKAP1LP55160 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCKAP1LP55160 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms