Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HADHBP55084 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HADHBP55084 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HADHBP55084 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HADHBP55084 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HADHBP55084 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HADHBP55084 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HADHBP55084 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HADHBP55084 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HADHBP55084 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HADHBP55084 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HADHBP55084 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HADHBP55084 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HADHBP55084 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HADHBP55084 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HADHBP55084 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HADHBP55084 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HADHBP55084 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HADHBP55084 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HADHBP55084 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HADHBP55084 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HADHBP55084 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HADHBP55084 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HADHBP55084 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HADHBP55084 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HADHBP55084 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HADHBP55084 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HADHBP55084 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HADHBP55084 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HADHBP55084 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HADHBP55084 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HADHBP55084 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HADHBP55084 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HADHBP55084 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HADHBP55084 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HADHBP55084 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HADHBP55084 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HADHBP55084 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HADHBP55084 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HADHBP55084 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HADHBP55084 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HADHBP55084 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HADHBP55084 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HADHBP55084 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HADHBP55084 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HADHBP55084 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HADHBP55084 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HADHBP55084 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HADHBP55084 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HADHBP55084 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HADHBP55084 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HADHBP55084 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HADHBP55084 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HADHBP55084 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HADHBP55084 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HADHBP55084 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms