Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLTPP55058 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLTPP55058 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLTPP55058 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLTPP55058 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLTPP55058 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLTPP55058 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLTPP55058 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLTPP55058 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLTPP55058 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLTPP55058 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLTPP55058 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLTPP55058 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLTPP55058 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLTPP55058 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLTPP55058 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLTPP55058 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLTPP55058 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLTPP55058 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLTPP55058 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLTPP55058 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLTPP55058 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLTPP55058 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLTPP55058 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLTPP55058 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLTPP55058 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLTPP55058 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLTPP55058 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLTPP55058 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLTPP55058 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLTPP55058 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLTPP55058 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLTPP55058 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLTPP55058 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLTPP55058 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLTPP55058 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLTPP55058 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLTPP55058 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLTPP55058 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLTPP55058 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLTPP55058 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLTPP55058 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLTPP55058 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLTPP55058 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLTPP55058 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLTPP55058 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLTPP55058 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLTPP55058 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLTPP55058 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLTPP55058 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PLTPP55058 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLTPP55058 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLTPP55058 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLTPP55058 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLTPP55058 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLTPP55058 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLTPP55058 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLTPP55058 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLTPP55058 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLTPP55058 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLTPP55058 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLTPP55058 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLTPP55058 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms