Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC5A3P53794 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A3P53794 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms